Я так понимаю, это вообще не было проверкой. Не плановой (поскольку ее нет на сайте Управления Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору по городу Москва, Московской и Тульской областям в разделе-Ежегодный план проведения плановых проверок на 2011 год
http://www.rsn-msk.ru/Malomu_i_srednemu … _2011_god/
(или вы все же в этом плане есть?)
Не внеплановой, поскольку никто не был извещен о такой проверке и она не была согласована с Прокуратурой Московской области.
Ну, к сожалению такая ситуация нисколько не выигрышна для жертвы конторы «Рога и копыта». Обычно это выглядит и обыгрывается  так – мы (Россельзознадзор) не проводили никаких проверок, но случайно проходя мимо выявили вопиющие нарушения законодательства в области ветеринарии и конечно не могли равнодушно пройти мимо. Для такого случайного выявления не требуется план ежегодных проверок, согласование с прокуратурой или уведомление о предстоящей операции госинспектора ветеринарной службы района. Виновнику вопиющего безобразия в виде отсутствия на территории частной конюшни санпропускника с подогреваемым дезбарьером, оборудованным автономной газовой котельной, карантинной площадки с отдельным изолятором имеющим разделение зон содержания животных и автономную систему жизнеобеспечения исключающую обычные конвенциональные условия, ну и ряда других мелких недостатков типа отсутствия трехметрового бетонного забора с колючей проволокой, вспаханной контрольной полосой, рвом и вышками с автоматчиками, эпикакого-то там журнала обязательно номер 2 и прочее, и прочее – применить административное взыскание в виде штрафа в 10 тыс. руб. (как юрлица), поскольку именно этой суммы не хватает для выполнения плана по штрафам за июнь месяц. Невыполнение плана вещь очень даже серьезная и грозит отсутствием премии, особенно для руководителей межрайонного отдела. А это значительная дыра в их семейном бюджете, срыв летней поездки на юг, или планируемой замены автомобиля. А может быть придется заморозить строительство долгожданного коттеджа. В общем, много каких добрых дел и начинаний, приятных моментов жизни и красивых вещей накроются медным тазом из-за заурядной жабы владельцев частной конюшни. Имейте же совесть наконец. Может тому проверяющему как раз Ваше железо и приглянулось. Вот он безобразие и выявил. Так восстановите законность, покройте этим железом евонный гараж. И одним нарушением законодательства в стране станет меньше.
А уведомление (вообще то должна быть повестка под роспись уполномоченного лица) кому вручили? Кто в нем (уведомлении этом) расписался? Штатный работник вашей конюшни? Тогда очень даже зря. Надо было ему сказать, что пошли бы вы на хр….н. Связывайтесь с руководством и отправляйте им официально по почте с уведомлением свои бумажки. Тем более, что проверки формально и не было, акта проверки, распоряжения на выполнение контрольного действа, согласования с прокуратурой, и даже простого предъявления служебных удостоверений как я понял не было. Надо бы было милицию вызвать, вот мол тут какие-то крутились, у частника из раздевалки барсетка с кучей баксов пропала – наверное эти и подрезали. А если конюха надежные и крепкие, то псевдопроверяющим могли бы харю набить, барсетку ту (с частником договорившись) этим проверяющим в карман запихать, скрутить их и милицию вызвать – вот мол поймали каких-то гляньте не они ли по раздевалкам сайгачат? Шутка конечно...
А если это уведомление не вручено под подпись работнику конюшни, а оставлено добровольно помогающей девочке с требованием передай начальству как появится, то такой «уведомление» с точки зрения Административной практики мягко говоря не является официальным документом и Вы никуда по нему не обязаны являться. Конечно, в Россельхознадзоре смогут составить протокол и без вашего участия, но вынесенное (тоже без вашего участия) по такому протоколу постановление обычно не приветствуется при прокурорской проверке самого Росслельхознадзора.
Ну и в конце концов есть практика судебного рассмотрения подобных споров. Рекомендую почитать на этом форуме темы про сходные случаи. дезбарьер , Правомерно ли требование ветслужбы
Есть еще вариант все же поехать в п. Знамя Октября в злополучный кабинет 318 в здании Государственного научного учреждения Всероссийский научно-исследовательский и проектно-технологический институт механизации животноводства Российской Академии сельскохозяйственных наук, где видимо и располагается уполномоченный составлять протоколы чиновник межрайонного отдела Управления Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору по городу Москва, Московской и Тульской областям и выяснить, насколько все серьезно. И почему так безалаберно со стороны проверяющих осуществлено. Возможно, попытка понять причину произошедшего у начальника отдела приведет к конструктивному диалогу и взаимопониманию. Хотя для РСХН это явление редкое. Но вы всегда имеете право указать в протоколе, что свою вину отрицаете, все указанное осуществлено с грубейшими нарушениями законодательства и получить свой экземпляр протокола с подписями должностных лиц Россельхознадзора и вашими объяснениями по произошедшему.
А вообще, если все действительно так, как Вы пишите, ищите  «доброжелателя» - возможно из числа конкурентов.
Удачи. (Она Вам понадобится)